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Les cours d'eau, partie intégrante du paysage hydrologique français, rassemblent une diversité floristique et faunistique caractéristique dont la préservation implique les notions de respect, de protection et d'exploitation rationnelle de la ressource. Depuis 2000, la directive cadre européenne sur l'eau définit le "bon état" comme l'un des objectifs environnementaux à atteindre pour l'ensemble des eaux au plus tard en 2015. L'accroissement continu de la demande en eau ainsi que les polluants et aménagements associés à l'activité humaine impliquent alors une surveillance accrue des cours d'eau.

Reflet de la diversité nationale des cours d'eau, les pages du portail présentent un échantillon représentatif du patrimoine propre à chaque bassin. Elles permettent en particulier de porter à la connaissance des usagers les nombreuses données d'observation (chimiques et physico-chimiques, biologiques,...) récoltées chaque année, par les professionnels, dans le cadre de réseaux de stations de mesure.